Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ME1P48163 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ME1P48163 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ME1P48163 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ME1P48163 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ME1P48163 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ME1P48163 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ME1P48163 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ME1P48163 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ME1P48163 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ME1P48163 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ME1P48163 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ME1P48163 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ME1P48163 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ME1P48163 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ME1P48163 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ME1P48163 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ME1P48163 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ME1P48163 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ME1P48163 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ME1P48163 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ME1P48163 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ME1P48163 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ME1P48163 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ME1P48163 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ME1P48163 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ME1P48163 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ME1P48163 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ME1P48163 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ME1P48163 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ME1P48163 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ME1P48163 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ME1P48163 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ME1P48163 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ME1P48163 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ME1P48163 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ME1P48163 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ME1P48163 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ME1P48163 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ME1P48163 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ME1P48163 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ME1P48163 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ME1P48163 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ME1P48163 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ME1P48163 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ME1P48163 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ME1P48163 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ME1P48163 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ME1P48163 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ME1P48163 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ME1P48163 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ME1P48163 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ME1P48163 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ME1P48163 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ME1P48163 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ME1P48163 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ME1P48163 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ME1P48163 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ME1P48163 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ME1P48163 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ME1P48163 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ME1P48163 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ME1P48163 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ME1P48163 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ME1P48163 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ME1P48163 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ME1P48163 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ME1P48163 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ME1P48163 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ME1P48163 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ME1P48163 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ME1P48163 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ME1P48163 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ME1P48163 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ME1P48163 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ME1P48163 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ME1P48163 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ME1P48163 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ME1P48163 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ME1P48163 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ME1P48163 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ME1P48163 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ME1P48163 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ME1P48163 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ME1P48163 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ME1P48163 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ME1P48163 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ME1P48163 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ME1P48163 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ME1P48163 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ME1P48163 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ME1P48163 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ME1P48163 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ME1P48163 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ME1P48163 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ME1P48163 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ME1P48163 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ME1P48163 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ME1P48163 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ME1P48163 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms