Protein–RNA interactions for Protein: B5MD39

GGTLC3, Putative glutathione hydrolase light chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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GGTLC3B5MD39 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GGTLC3B5MD39 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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