Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms