Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG8

KCNK4, Potassium channel subfamily K member 4, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK4Q9NYG8 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNK4Q9NYG8 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms