Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms