Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC27A3Q5K4L6 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms