Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 AC027348.2-201ENST00000624375 642 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
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LAPTM4AQ15012 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
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LAPTM4AQ15012 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
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LAPTM4AQ15012 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
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LAPTM4AQ15012 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
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LAPTM4AQ15012 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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LAPTM4AQ15012 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
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LAPTM4AQ15012 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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