Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HBBP68871 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HBBP68871 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HBBP68871 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HBBP68871 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HBBP68871 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HBBP68871 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HBBP68871 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HBBP68871 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HBBP68871 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HBBP68871 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HBBP68871 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HBBP68871 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HBBP68871 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HBBP68871 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
HBBP68871 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HBBP68871 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
HBBP68871 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HBBP68871 SPTBN2-204ENST00000529997 8085 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HBBP68871 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HBBP68871 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HBBP68871 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HBBP68871 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
HBBP68871 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
HBBP68871 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
HBBP68871 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HBBP68871 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
HBBP68871 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HBBP68871 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HBBP68871 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HBBP68871 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HBBP68871 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HBBP68871 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HBBP68871 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HBBP68871 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HBBP68871 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HBBP68871 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
HBBP68871 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HBBP68871 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HBBP68871 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HBBP68871 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HBBP68871 TRAK1-201ENST00000327628 5293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HBBP68871 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HBBP68871 ITPR3-202ENST00000605930 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HBBP68871 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HBBP68871 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HBBP68871 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HBBP68871 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HBBP68871 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HBBP68871 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HBBP68871 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
HBBP68871 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HBBP68871 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HBBP68871 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HBBP68871 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HBBP68871 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HBBP68871 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HBBP68871 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HBBP68871 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HBBP68871 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HBBP68871 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HBBP68871 LAMA3-202ENST00000313654 10661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HBBP68871 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HBBP68871 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HBBP68871 COL6A3-206ENST00000409809 8916 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HBBP68871 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HBBP68871 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HBBP68871 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HBBP68871 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
HBBP68871 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HBBP68871 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HBBP68871 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HBBP68871 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HBBP68871 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HBBP68871 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HBBP68871 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HBBP68871 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
HBBP68871 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HBBP68871 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HBBP68871 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HBBP68871 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HBBP68871 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HBBP68871 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HBBP68871 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HBBP68871 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HBBP68871 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HBBP68871 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HBBP68871 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HBBP68871 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HBBP68871 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HBBP68871 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HBBP68871 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HBBP68871 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HBBP68871 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HBBP68871 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HBBP68871 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HBBP68871 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HBBP68871 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
HBBP68871 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HBBP68871 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms