Protein–RNA interactions for Protein: P16234

PDGFRA, Platelet-derived growth factor receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRAP16234 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDGFRAP16234 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms