Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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