Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X8

UBE2D4, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2D4Q9Y2X8 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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UBE2D4Q9Y2X8 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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UBE2D4Q9Y2X8 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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UBE2D4Q9Y2X8 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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UBE2D4Q9Y2X8 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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UBE2D4Q9Y2X8 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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UBE2D4Q9Y2X8 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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UBE2D4Q9Y2X8 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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UBE2D4Q9Y2X8 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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