Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTF1AQ7RTS3 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTF1AQ7RTS3 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTF1AQ7RTS3 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTF1AQ7RTS3 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTF1AQ7RTS3 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTF1AQ7RTS3 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTF1AQ7RTS3 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTF1AQ7RTS3 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTF1AQ7RTS3 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTF1AQ7RTS3 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTF1AQ7RTS3 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTF1AQ7RTS3 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTF1AQ7RTS3 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTF1AQ7RTS3 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTF1AQ7RTS3 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTF1AQ7RTS3 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTF1AQ7RTS3 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTF1AQ7RTS3 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTF1AQ7RTS3 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PTF1AQ7RTS3 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTF1AQ7RTS3 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTF1AQ7RTS3 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTF1AQ7RTS3 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTF1AQ7RTS3 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PTF1AQ7RTS3 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTF1AQ7RTS3 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTF1AQ7RTS3 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PTF1AQ7RTS3 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTF1AQ7RTS3 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PTF1AQ7RTS3 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTF1AQ7RTS3 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTF1AQ7RTS3 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTF1AQ7RTS3 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTF1AQ7RTS3 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTF1AQ7RTS3 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTF1AQ7RTS3 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTF1AQ7RTS3 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTF1AQ7RTS3 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTF1AQ7RTS3 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTF1AQ7RTS3 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTF1AQ7RTS3 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTF1AQ7RTS3 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTF1AQ7RTS3 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTF1AQ7RTS3 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTF1AQ7RTS3 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTF1AQ7RTS3 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTF1AQ7RTS3 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTF1AQ7RTS3 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTF1AQ7RTS3 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTF1AQ7RTS3 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTF1AQ7RTS3 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PTF1AQ7RTS3 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTF1AQ7RTS3 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTF1AQ7RTS3 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PTF1AQ7RTS3 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PTF1AQ7RTS3 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTF1AQ7RTS3 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTF1AQ7RTS3 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTF1AQ7RTS3 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTF1AQ7RTS3 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTF1AQ7RTS3 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTF1AQ7RTS3 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTF1AQ7RTS3 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTF1AQ7RTS3 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTF1AQ7RTS3 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTF1AQ7RTS3 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTF1AQ7RTS3 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTF1AQ7RTS3 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTF1AQ7RTS3 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTF1AQ7RTS3 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTF1AQ7RTS3 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTF1AQ7RTS3 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTF1AQ7RTS3 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTF1AQ7RTS3 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTF1AQ7RTS3 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTF1AQ7RTS3 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTF1AQ7RTS3 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTF1AQ7RTS3 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTF1AQ7RTS3 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTF1AQ7RTS3 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTF1AQ7RTS3 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTF1AQ7RTS3 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTF1AQ7RTS3 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTF1AQ7RTS3 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTF1AQ7RTS3 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PTF1AQ7RTS3 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTF1AQ7RTS3 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PTF1AQ7RTS3 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTF1AQ7RTS3 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTF1AQ7RTS3 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTF1AQ7RTS3 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTF1AQ7RTS3 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTF1AQ7RTS3 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTF1AQ7RTS3 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTF1AQ7RTS3 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PTF1AQ7RTS3 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTF1AQ7RTS3 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTF1AQ7RTS3 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PTF1AQ7RTS3 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms