Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 ALG1L7P-201ENST00000502317 768 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 AC009950.1-210ENST00000594622 553 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 HNRNPA1P42-201ENST00000458678 957 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 KLF3-AS1-203ENST00000504219 627 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 AC020904.3-201ENST00000624199 442 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
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SHROOM2Q13796 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
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SHROOM2Q13796 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 LINC01983-201ENST00000413586 574 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 BCRP4-201ENST00000506079 804 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 KNOP1P1-201ENST00000542108 989 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 AC019294.2-203ENST00000569596 594 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SHROOM2Q13796 LCN6-201ENST00000341206 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
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