Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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