Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU1

IGDCC3, Immunoglobulin superfamily DCC subclass member 3, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGDCC3Q8IVU1 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGDCC3Q8IVU1 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms