Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRMS1LQ5PSV4 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRMS1LQ5PSV4 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRMS1LQ5PSV4 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRMS1LQ5PSV4 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRMS1LQ5PSV4 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRMS1LQ5PSV4 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRMS1LQ5PSV4 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRMS1LQ5PSV4 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRMS1LQ5PSV4 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BRMS1LQ5PSV4 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BRMS1LQ5PSV4 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BRMS1LQ5PSV4 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BRMS1LQ5PSV4 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BRMS1LQ5PSV4 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BRMS1LQ5PSV4 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BRMS1LQ5PSV4 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BRMS1LQ5PSV4 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BRMS1LQ5PSV4 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BRMS1LQ5PSV4 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BRMS1LQ5PSV4 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BRMS1LQ5PSV4 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BRMS1LQ5PSV4 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BRMS1LQ5PSV4 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BRMS1LQ5PSV4 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
BRMS1LQ5PSV4 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BRMS1LQ5PSV4 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BRMS1LQ5PSV4 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
BRMS1LQ5PSV4 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
BRMS1LQ5PSV4 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BRMS1LQ5PSV4 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BRMS1LQ5PSV4 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BRMS1LQ5PSV4 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BRMS1LQ5PSV4 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BRMS1LQ5PSV4 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BRMS1LQ5PSV4 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BRMS1LQ5PSV4 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BRMS1LQ5PSV4 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BRMS1LQ5PSV4 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BRMS1LQ5PSV4 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BRMS1LQ5PSV4 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BRMS1LQ5PSV4 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BRMS1LQ5PSV4 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BRMS1LQ5PSV4 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BRMS1LQ5PSV4 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BRMS1LQ5PSV4 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BRMS1LQ5PSV4 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BRMS1LQ5PSV4 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BRMS1LQ5PSV4 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BRMS1LQ5PSV4 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
BRMS1LQ5PSV4 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.1
BRMS1LQ5PSV4 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
BRMS1LQ5PSV4 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
BRMS1LQ5PSV4 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
BRMS1LQ5PSV4 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
BRMS1LQ5PSV4 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
BRMS1LQ5PSV4 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
BRMS1LQ5PSV4 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
BRMS1LQ5PSV4 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BRMS1LQ5PSV4 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BRMS1LQ5PSV4 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BRMS1LQ5PSV4 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BRMS1LQ5PSV4 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BRMS1LQ5PSV4 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BRMS1LQ5PSV4 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BRMS1LQ5PSV4 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BRMS1LQ5PSV4 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BRMS1LQ5PSV4 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BRMS1LQ5PSV4 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BRMS1LQ5PSV4 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BRMS1LQ5PSV4 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BRMS1LQ5PSV4 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BRMS1LQ5PSV4 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BRMS1LQ5PSV4 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
BRMS1LQ5PSV4 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BRMS1LQ5PSV4 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
BRMS1LQ5PSV4 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BRMS1LQ5PSV4 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BRMS1LQ5PSV4 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BRMS1LQ5PSV4 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
BRMS1LQ5PSV4 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BRMS1LQ5PSV4 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BRMS1LQ5PSV4 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BRMS1LQ5PSV4 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BRMS1LQ5PSV4 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BRMS1LQ5PSV4 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BRMS1LQ5PSV4 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BRMS1LQ5PSV4 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BRMS1LQ5PSV4 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BRMS1LQ5PSV4 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BRMS1LQ5PSV4 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BRMS1LQ5PSV4 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BRMS1LQ5PSV4 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BRMS1LQ5PSV4 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BRMS1LQ5PSV4 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
BRMS1LQ5PSV4 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BRMS1LQ5PSV4 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BRMS1LQ5PSV4 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BRMS1LQ5PSV4 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BRMS1LQ5PSV4 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms