Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms