Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
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PTP4A2Q12974 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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PTP4A2Q12974 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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PTP4A2Q12974 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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PTP4A2Q12974 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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