Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms