Protein–RNA interactions for Protein: P12004

PCNA, Proliferating cell nuclear antigen, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNAP12004 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCNAP12004 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PCNAP12004 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PCNAP12004 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PCNAP12004 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCNAP12004 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PCNAP12004 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PCNAP12004 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCNAP12004 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCNAP12004 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCNAP12004 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCNAP12004 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCNAP12004 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCNAP12004 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCNAP12004 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCNAP12004 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCNAP12004 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCNAP12004 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCNAP12004 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCNAP12004 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCNAP12004 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCNAP12004 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCNAP12004 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCNAP12004 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCNAP12004 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCNAP12004 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCNAP12004 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PCNAP12004 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PCNAP12004 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PCNAP12004 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PCNAP12004 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCNAP12004 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCNAP12004 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCNAP12004 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCNAP12004 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCNAP12004 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PCNAP12004 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCNAP12004 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCNAP12004 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCNAP12004 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PCNAP12004 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PCNAP12004 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCNAP12004 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCNAP12004 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCNAP12004 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCNAP12004 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCNAP12004 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCNAP12004 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCNAP12004 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCNAP12004 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCNAP12004 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCNAP12004 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCNAP12004 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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PCNAP12004 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCNAP12004 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCNAP12004 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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PCNAP12004 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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PCNAP12004 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PCNAP12004 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCNAP12004 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCNAP12004 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCNAP12004 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PCNAP12004 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCNAP12004 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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PCNAP12004 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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PCNAP12004 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCNAP12004 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCNAP12004 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCNAP12004 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCNAP12004 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCNAP12004 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCNAP12004 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCNAP12004 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCNAP12004 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCNAP12004 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCNAP12004 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCNAP12004 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCNAP12004 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCNAP12004 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCNAP12004 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCNAP12004 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCNAP12004 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCNAP12004 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCNAP12004 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCNAP12004 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCNAP12004 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCNAP12004 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCNAP12004 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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