Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXP7

GIN1, Gypsy retrotransposon integrase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIN1Q9NXP7 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
GIN1Q9NXP7 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GIN1Q9NXP7 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms