Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms