Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUK0

CHCHD7, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 7, humanhuman

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Length 85 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD7Q9BUK0 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
CHCHD7Q9BUK0 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
CHCHD7Q9BUK0 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
CHCHD7Q9BUK0 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
CHCHD7Q9BUK0 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
CHCHD7Q9BUK0 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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CHCHD7Q9BUK0 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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CHCHD7Q9BUK0 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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CHCHD7Q9BUK0 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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CHCHD7Q9BUK0 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
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CHCHD7Q9BUK0 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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CHCHD7Q9BUK0 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CHCHD7Q9BUK0 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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