Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF397Q8NF99 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148 ms