Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 AFF1-201ENST00000307808 9390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms