Protein–RNA interactions for Protein: P40222

TXLNA, Alpha-taxilin, humanhuman

Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXLNAP40222 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms