Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 AC012617.1-201ENST00000586345 797 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 AC142086.5-202ENST00000562500 217 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 ODF3L1-201ENST00000332145 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 DDR1-225ENST00000376568 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms