Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT99

LRRC38, Leucine-rich repeat-containing protein 38, humanhuman

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Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC38Q5VT99 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC38Q5VT99 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC38Q5VT99 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC38Q5VT99 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC38Q5VT99 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC38Q5VT99 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC38Q5VT99 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC38Q5VT99 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC38Q5VT99 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC38Q5VT99 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC38Q5VT99 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC38Q5VT99 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC38Q5VT99 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC38Q5VT99 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC38Q5VT99 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC38Q5VT99 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC38Q5VT99 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC38Q5VT99 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC38Q5VT99 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC38Q5VT99 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC38Q5VT99 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC38Q5VT99 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC38Q5VT99 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC38Q5VT99 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC38Q5VT99 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC38Q5VT99 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC38Q5VT99 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC38Q5VT99 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC38Q5VT99 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC38Q5VT99 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC38Q5VT99 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC38Q5VT99 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC38Q5VT99 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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LRRC38Q5VT99 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC38Q5VT99 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC38Q5VT99 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC38Q5VT99 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC38Q5VT99 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC38Q5VT99 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC38Q5VT99 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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LRRC38Q5VT99 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC38Q5VT99 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC38Q5VT99 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC38Q5VT99 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC38Q5VT99 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC38Q5VT99 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC38Q5VT99 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC38Q5VT99 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC38Q5VT99 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC38Q5VT99 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC38Q5VT99 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC38Q5VT99 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC38Q5VT99 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC38Q5VT99 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC38Q5VT99 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC38Q5VT99 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC38Q5VT99 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC38Q5VT99 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC38Q5VT99 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC38Q5VT99 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LRRC38Q5VT99 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LRRC38Q5VT99 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
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LRRC38Q5VT99 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
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LRRC38Q5VT99 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LRRC38Q5VT99 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRC38Q5VT99 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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LRRC38Q5VT99 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRC38Q5VT99 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRC38Q5VT99 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRC38Q5VT99 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRC38Q5VT99 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRC38Q5VT99 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRC38Q5VT99 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRC38Q5VT99 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRC38Q5VT99 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRC38Q5VT99 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRC38Q5VT99 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRC38Q5VT99 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRC38Q5VT99 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRC38Q5VT99 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRC38Q5VT99 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRC38Q5VT99 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRC38Q5VT99 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRC38Q5VT99 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRC38Q5VT99 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRC38Q5VT99 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRC38Q5VT99 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRC38Q5VT99 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRC38Q5VT99 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRC38Q5VT99 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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