Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms