Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms