Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB4

ATXN10, Ataxin-10, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN10Q9UBB4 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN10Q9UBB4 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN10Q9UBB4 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN10Q9UBB4 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN10Q9UBB4 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN10Q9UBB4 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN10Q9UBB4 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN10Q9UBB4 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN10Q9UBB4 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN10Q9UBB4 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN10Q9UBB4 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN10Q9UBB4 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN10Q9UBB4 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN10Q9UBB4 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN10Q9UBB4 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN10Q9UBB4 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN10Q9UBB4 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN10Q9UBB4 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN10Q9UBB4 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN10Q9UBB4 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN10Q9UBB4 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN10Q9UBB4 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN10Q9UBB4 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN10Q9UBB4 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN10Q9UBB4 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN10Q9UBB4 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN10Q9UBB4 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN10Q9UBB4 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN10Q9UBB4 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN10Q9UBB4 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN10Q9UBB4 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN10Q9UBB4 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN10Q9UBB4 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN10Q9UBB4 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN10Q9UBB4 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN10Q9UBB4 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN10Q9UBB4 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN10Q9UBB4 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN10Q9UBB4 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN10Q9UBB4 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN10Q9UBB4 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN10Q9UBB4 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN10Q9UBB4 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN10Q9UBB4 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN10Q9UBB4 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN10Q9UBB4 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN10Q9UBB4 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN10Q9UBB4 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN10Q9UBB4 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN10Q9UBB4 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN10Q9UBB4 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN10Q9UBB4 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN10Q9UBB4 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN10Q9UBB4 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN10Q9UBB4 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN10Q9UBB4 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN10Q9UBB4 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN10Q9UBB4 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN10Q9UBB4 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN10Q9UBB4 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN10Q9UBB4 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN10Q9UBB4 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN10Q9UBB4 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN10Q9UBB4 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN10Q9UBB4 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN10Q9UBB4 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN10Q9UBB4 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN10Q9UBB4 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN10Q9UBB4 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN10Q9UBB4 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN10Q9UBB4 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN10Q9UBB4 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN10Q9UBB4 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN10Q9UBB4 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN10Q9UBB4 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN10Q9UBB4 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN10Q9UBB4 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN10Q9UBB4 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN10Q9UBB4 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN10Q9UBB4 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN10Q9UBB4 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN10Q9UBB4 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN10Q9UBB4 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN10Q9UBB4 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN10Q9UBB4 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN10Q9UBB4 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN10Q9UBB4 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN10Q9UBB4 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN10Q9UBB4 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN10Q9UBB4 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN10Q9UBB4 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN10Q9UBB4 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN10Q9UBB4 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN10Q9UBB4 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN10Q9UBB4 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN10Q9UBB4 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN10Q9UBB4 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN10Q9UBB4 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN10Q9UBB4 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN10Q9UBB4 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms