Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 201.3 ms