Protein–RNA interactions for Protein: Q92520

FAM3C, Protein FAM3C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3CQ92520 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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