Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 PIGG-208ENST00000504346 3019 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 EIF3L-214ENST00000624234 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms