Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms