Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC12.5□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC12.5□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC12.49□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms