Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX8Q9Y5X2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX8Q9Y5X2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX8Q9Y5X2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX8Q9Y5X2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX8Q9Y5X2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX8Q9Y5X2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX8Q9Y5X2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX8Q9Y5X2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX8Q9Y5X2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX8Q9Y5X2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX8Q9Y5X2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX8Q9Y5X2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX8Q9Y5X2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX8Q9Y5X2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SNX8Q9Y5X2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SNX8Q9Y5X2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX8Q9Y5X2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX8Q9Y5X2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX8Q9Y5X2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX8Q9Y5X2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX8Q9Y5X2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX8Q9Y5X2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX8Q9Y5X2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX8Q9Y5X2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX8Q9Y5X2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX8Q9Y5X2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX8Q9Y5X2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX8Q9Y5X2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX8Q9Y5X2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX8Q9Y5X2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX8Q9Y5X2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX8Q9Y5X2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX8Q9Y5X2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX8Q9Y5X2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX8Q9Y5X2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX8Q9Y5X2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX8Q9Y5X2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX8Q9Y5X2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX8Q9Y5X2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX8Q9Y5X2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX8Q9Y5X2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX8Q9Y5X2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX8Q9Y5X2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX8Q9Y5X2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX8Q9Y5X2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX8Q9Y5X2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX8Q9Y5X2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX8Q9Y5X2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX8Q9Y5X2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX8Q9Y5X2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX8Q9Y5X2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX8Q9Y5X2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX8Q9Y5X2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX8Q9Y5X2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX8Q9Y5X2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX8Q9Y5X2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX8Q9Y5X2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX8Q9Y5X2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX8Q9Y5X2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX8Q9Y5X2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX8Q9Y5X2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX8Q9Y5X2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX8Q9Y5X2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX8Q9Y5X2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX8Q9Y5X2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX8Q9Y5X2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX8Q9Y5X2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX8Q9Y5X2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX8Q9Y5X2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX8Q9Y5X2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX8Q9Y5X2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX8Q9Y5X2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX8Q9Y5X2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX8Q9Y5X2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX8Q9Y5X2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX8Q9Y5X2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX8Q9Y5X2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX8Q9Y5X2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX8Q9Y5X2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX8Q9Y5X2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX8Q9Y5X2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX8Q9Y5X2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX8Q9Y5X2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX8Q9Y5X2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX8Q9Y5X2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX8Q9Y5X2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX8Q9Y5X2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX8Q9Y5X2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX8Q9Y5X2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX8Q9Y5X2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX8Q9Y5X2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX8Q9Y5X2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX8Q9Y5X2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX8Q9Y5X2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX8Q9Y5X2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX8Q9Y5X2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX8Q9Y5X2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX8Q9Y5X2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX8Q9Y5X2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms