Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKZ1

CNOT11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT11Q9UKZ1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CNOT11Q9UKZ1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNOT11Q9UKZ1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNOT11Q9UKZ1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNOT11Q9UKZ1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNOT11Q9UKZ1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNOT11Q9UKZ1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNOT11Q9UKZ1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNOT11Q9UKZ1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNOT11Q9UKZ1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNOT11Q9UKZ1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNOT11Q9UKZ1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNOT11Q9UKZ1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNOT11Q9UKZ1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNOT11Q9UKZ1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNOT11Q9UKZ1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNOT11Q9UKZ1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNOT11Q9UKZ1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNOT11Q9UKZ1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNOT11Q9UKZ1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNOT11Q9UKZ1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNOT11Q9UKZ1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNOT11Q9UKZ1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNOT11Q9UKZ1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNOT11Q9UKZ1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNOT11Q9UKZ1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNOT11Q9UKZ1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNOT11Q9UKZ1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNOT11Q9UKZ1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNOT11Q9UKZ1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNOT11Q9UKZ1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNOT11Q9UKZ1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNOT11Q9UKZ1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNOT11Q9UKZ1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNOT11Q9UKZ1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNOT11Q9UKZ1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNOT11Q9UKZ1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNOT11Q9UKZ1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNOT11Q9UKZ1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNOT11Q9UKZ1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNOT11Q9UKZ1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNOT11Q9UKZ1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CNOT11Q9UKZ1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNOT11Q9UKZ1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNOT11Q9UKZ1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNOT11Q9UKZ1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNOT11Q9UKZ1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNOT11Q9UKZ1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNOT11Q9UKZ1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNOT11Q9UKZ1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNOT11Q9UKZ1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNOT11Q9UKZ1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNOT11Q9UKZ1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNOT11Q9UKZ1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNOT11Q9UKZ1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNOT11Q9UKZ1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNOT11Q9UKZ1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNOT11Q9UKZ1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNOT11Q9UKZ1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNOT11Q9UKZ1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNOT11Q9UKZ1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNOT11Q9UKZ1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNOT11Q9UKZ1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNOT11Q9UKZ1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNOT11Q9UKZ1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNOT11Q9UKZ1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNOT11Q9UKZ1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNOT11Q9UKZ1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNOT11Q9UKZ1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNOT11Q9UKZ1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNOT11Q9UKZ1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNOT11Q9UKZ1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNOT11Q9UKZ1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNOT11Q9UKZ1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNOT11Q9UKZ1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNOT11Q9UKZ1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNOT11Q9UKZ1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNOT11Q9UKZ1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNOT11Q9UKZ1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CNOT11Q9UKZ1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNOT11Q9UKZ1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNOT11Q9UKZ1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNOT11Q9UKZ1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNOT11Q9UKZ1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNOT11Q9UKZ1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNOT11Q9UKZ1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNOT11Q9UKZ1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNOT11Q9UKZ1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNOT11Q9UKZ1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNOT11Q9UKZ1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNOT11Q9UKZ1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNOT11Q9UKZ1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNOT11Q9UKZ1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNOT11Q9UKZ1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNOT11Q9UKZ1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNOT11Q9UKZ1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNOT11Q9UKZ1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNOT11Q9UKZ1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNOT11Q9UKZ1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNOT11Q9UKZ1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms