Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR33

POLE4, DNA polymerase epsilon subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE4Q9NR33 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLE4Q9NR33 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLE4Q9NR33 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLE4Q9NR33 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
POLE4Q9NR33 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
POLE4Q9NR33 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
POLE4Q9NR33 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
POLE4Q9NR33 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
POLE4Q9NR33 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
POLE4Q9NR33 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
POLE4Q9NR33 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21■□□□□ 0.95
POLE4Q9NR33 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21■□□□□ 0.95
POLE4Q9NR33 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
POLE4Q9NR33 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
POLE4Q9NR33 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
POLE4Q9NR33 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
POLE4Q9NR33 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
POLE4Q9NR33 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLE4Q9NR33 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLE4Q9NR33 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLE4Q9NR33 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLE4Q9NR33 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLE4Q9NR33 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLE4Q9NR33 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLE4Q9NR33 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLE4Q9NR33 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLE4Q9NR33 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLE4Q9NR33 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLE4Q9NR33 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLE4Q9NR33 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLE4Q9NR33 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLE4Q9NR33 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLE4Q9NR33 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLE4Q9NR33 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
POLE4Q9NR33 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLE4Q9NR33 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLE4Q9NR33 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLE4Q9NR33 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLE4Q9NR33 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLE4Q9NR33 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLE4Q9NR33 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLE4Q9NR33 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLE4Q9NR33 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLE4Q9NR33 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLE4Q9NR33 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLE4Q9NR33 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLE4Q9NR33 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLE4Q9NR33 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLE4Q9NR33 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLE4Q9NR33 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLE4Q9NR33 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLE4Q9NR33 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLE4Q9NR33 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLE4Q9NR33 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLE4Q9NR33 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLE4Q9NR33 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLE4Q9NR33 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLE4Q9NR33 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLE4Q9NR33 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLE4Q9NR33 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLE4Q9NR33 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLE4Q9NR33 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLE4Q9NR33 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLE4Q9NR33 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLE4Q9NR33 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
POLE4Q9NR33 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.95
POLE4Q9NR33 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
POLE4Q9NR33 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
POLE4Q9NR33 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
POLE4Q9NR33 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLE4Q9NR33 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLE4Q9NR33 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLE4Q9NR33 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLE4Q9NR33 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
POLE4Q9NR33 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLE4Q9NR33 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLE4Q9NR33 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLE4Q9NR33 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLE4Q9NR33 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLE4Q9NR33 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLE4Q9NR33 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLE4Q9NR33 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLE4Q9NR33 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLE4Q9NR33 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLE4Q9NR33 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLE4Q9NR33 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLE4Q9NR33 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLE4Q9NR33 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
POLE4Q9NR33 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLE4Q9NR33 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLE4Q9NR33 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLE4Q9NR33 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
POLE4Q9NR33 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
POLE4Q9NR33 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
POLE4Q9NR33 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
POLE4Q9NR33 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
POLE4Q9NR33 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
POLE4Q9NR33 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
POLE4Q9NR33 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
POLE4Q9NR33 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms