Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR19

ACSS2, Acetyl-coenzyme A synthetase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSS2Q9NR19 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACSS2Q9NR19 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ACSS2Q9NR19 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACSS2Q9NR19 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACSS2Q9NR19 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACSS2Q9NR19 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ACSS2Q9NR19 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACSS2Q9NR19 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACSS2Q9NR19 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACSS2Q9NR19 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACSS2Q9NR19 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACSS2Q9NR19 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ACSS2Q9NR19 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACSS2Q9NR19 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACSS2Q9NR19 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACSS2Q9NR19 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
ACSS2Q9NR19 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ACSS2Q9NR19 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ACSS2Q9NR19 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ACSS2Q9NR19 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACSS2Q9NR19 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACSS2Q9NR19 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACSS2Q9NR19 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACSS2Q9NR19 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACSS2Q9NR19 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACSS2Q9NR19 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACSS2Q9NR19 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACSS2Q9NR19 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACSS2Q9NR19 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACSS2Q9NR19 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACSS2Q9NR19 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACSS2Q9NR19 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACSS2Q9NR19 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACSS2Q9NR19 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACSS2Q9NR19 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACSS2Q9NR19 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACSS2Q9NR19 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACSS2Q9NR19 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACSS2Q9NR19 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACSS2Q9NR19 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACSS2Q9NR19 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACSS2Q9NR19 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACSS2Q9NR19 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACSS2Q9NR19 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACSS2Q9NR19 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACSS2Q9NR19 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACSS2Q9NR19 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACSS2Q9NR19 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACSS2Q9NR19 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACSS2Q9NR19 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACSS2Q9NR19 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACSS2Q9NR19 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACSS2Q9NR19 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACSS2Q9NR19 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACSS2Q9NR19 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACSS2Q9NR19 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACSS2Q9NR19 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACSS2Q9NR19 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACSS2Q9NR19 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACSS2Q9NR19 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACSS2Q9NR19 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACSS2Q9NR19 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACSS2Q9NR19 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACSS2Q9NR19 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACSS2Q9NR19 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACSS2Q9NR19 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACSS2Q9NR19 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACSS2Q9NR19 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACSS2Q9NR19 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACSS2Q9NR19 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACSS2Q9NR19 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACSS2Q9NR19 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACSS2Q9NR19 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACSS2Q9NR19 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACSS2Q9NR19 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACSS2Q9NR19 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACSS2Q9NR19 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ACSS2Q9NR19 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACSS2Q9NR19 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACSS2Q9NR19 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACSS2Q9NR19 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ACSS2Q9NR19 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACSS2Q9NR19 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACSS2Q9NR19 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACSS2Q9NR19 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACSS2Q9NR19 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACSS2Q9NR19 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACSS2Q9NR19 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACSS2Q9NR19 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACSS2Q9NR19 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACSS2Q9NR19 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACSS2Q9NR19 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACSS2Q9NR19 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACSS2Q9NR19 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACSS2Q9NR19 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACSS2Q9NR19 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACSS2Q9NR19 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACSS2Q9NR19 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACSS2Q9NR19 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACSS2Q9NR19 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms