Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7L9

SUDS3, Sin3 histone deacetylase corepressor complex component SDS3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUDS3Q9H7L9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SUDS3Q9H7L9 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SUDS3Q9H7L9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SUDS3Q9H7L9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SUDS3Q9H7L9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SUDS3Q9H7L9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SUDS3Q9H7L9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SUDS3Q9H7L9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SUDS3Q9H7L9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SUDS3Q9H7L9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SUDS3Q9H7L9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SUDS3Q9H7L9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SUDS3Q9H7L9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUDS3Q9H7L9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUDS3Q9H7L9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUDS3Q9H7L9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUDS3Q9H7L9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUDS3Q9H7L9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUDS3Q9H7L9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUDS3Q9H7L9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUDS3Q9H7L9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUDS3Q9H7L9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUDS3Q9H7L9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SUDS3Q9H7L9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SUDS3Q9H7L9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SUDS3Q9H7L9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SUDS3Q9H7L9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SUDS3Q9H7L9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SUDS3Q9H7L9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SUDS3Q9H7L9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SUDS3Q9H7L9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SUDS3Q9H7L9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SUDS3Q9H7L9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SUDS3Q9H7L9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SUDS3Q9H7L9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SUDS3Q9H7L9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SUDS3Q9H7L9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SUDS3Q9H7L9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SUDS3Q9H7L9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SUDS3Q9H7L9 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SUDS3Q9H7L9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SUDS3Q9H7L9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SUDS3Q9H7L9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SUDS3Q9H7L9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SUDS3Q9H7L9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SUDS3Q9H7L9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SUDS3Q9H7L9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SUDS3Q9H7L9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
SUDS3Q9H7L9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SUDS3Q9H7L9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
SUDS3Q9H7L9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SUDS3Q9H7L9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SUDS3Q9H7L9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SUDS3Q9H7L9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SUDS3Q9H7L9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SUDS3Q9H7L9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SUDS3Q9H7L9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SUDS3Q9H7L9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SUDS3Q9H7L9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SUDS3Q9H7L9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SUDS3Q9H7L9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SUDS3Q9H7L9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SUDS3Q9H7L9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SUDS3Q9H7L9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SUDS3Q9H7L9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SUDS3Q9H7L9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SUDS3Q9H7L9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SUDS3Q9H7L9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SUDS3Q9H7L9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SUDS3Q9H7L9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SUDS3Q9H7L9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SUDS3Q9H7L9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SUDS3Q9H7L9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SUDS3Q9H7L9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SUDS3Q9H7L9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SUDS3Q9H7L9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SUDS3Q9H7L9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SUDS3Q9H7L9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SUDS3Q9H7L9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SUDS3Q9H7L9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SUDS3Q9H7L9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SUDS3Q9H7L9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SUDS3Q9H7L9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SUDS3Q9H7L9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SUDS3Q9H7L9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SUDS3Q9H7L9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SUDS3Q9H7L9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SUDS3Q9H7L9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SUDS3Q9H7L9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SUDS3Q9H7L9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SUDS3Q9H7L9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SUDS3Q9H7L9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SUDS3Q9H7L9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SUDS3Q9H7L9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SUDS3Q9H7L9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SUDS3Q9H7L9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SUDS3Q9H7L9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SUDS3Q9H7L9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SUDS3Q9H7L9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SUDS3Q9H7L9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104 ms