Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2F9

CCDC68, Coiled-coil domain-containing protein 68, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC68Q9H2F9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC68Q9H2F9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC68Q9H2F9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC68Q9H2F9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC68Q9H2F9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC68Q9H2F9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC68Q9H2F9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC68Q9H2F9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC68Q9H2F9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC68Q9H2F9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC68Q9H2F9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC68Q9H2F9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC68Q9H2F9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC68Q9H2F9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC68Q9H2F9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC68Q9H2F9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC68Q9H2F9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC68Q9H2F9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC68Q9H2F9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC68Q9H2F9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC68Q9H2F9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC68Q9H2F9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC68Q9H2F9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCDC68Q9H2F9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC68Q9H2F9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC68Q9H2F9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC68Q9H2F9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC68Q9H2F9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC68Q9H2F9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC68Q9H2F9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC68Q9H2F9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC68Q9H2F9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC68Q9H2F9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC68Q9H2F9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC68Q9H2F9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC68Q9H2F9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC68Q9H2F9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC68Q9H2F9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC68Q9H2F9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC68Q9H2F9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC68Q9H2F9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC68Q9H2F9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC68Q9H2F9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC68Q9H2F9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC68Q9H2F9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC68Q9H2F9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC68Q9H2F9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC68Q9H2F9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC68Q9H2F9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC68Q9H2F9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC68Q9H2F9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC68Q9H2F9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC68Q9H2F9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC68Q9H2F9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC68Q9H2F9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC68Q9H2F9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC68Q9H2F9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC68Q9H2F9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC68Q9H2F9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC68Q9H2F9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC68Q9H2F9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC68Q9H2F9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC68Q9H2F9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC68Q9H2F9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC68Q9H2F9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC68Q9H2F9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC68Q9H2F9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC68Q9H2F9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC68Q9H2F9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC68Q9H2F9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC68Q9H2F9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC68Q9H2F9 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC68Q9H2F9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC68Q9H2F9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC68Q9H2F9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC68Q9H2F9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC68Q9H2F9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC68Q9H2F9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC68Q9H2F9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC68Q9H2F9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC68Q9H2F9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC68Q9H2F9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC68Q9H2F9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC68Q9H2F9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC68Q9H2F9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC68Q9H2F9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC68Q9H2F9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC68Q9H2F9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC68Q9H2F9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC68Q9H2F9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC68Q9H2F9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC68Q9H2F9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC68Q9H2F9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC68Q9H2F9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC68Q9H2F9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC68Q9H2F9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC68Q9H2F9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC68Q9H2F9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC68Q9H2F9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC68Q9H2F9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms