Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXD1Q9GZZ0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXD1Q9GZZ0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXD1Q9GZZ0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXD1Q9GZZ0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXD1Q9GZZ0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXD1Q9GZZ0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXD1Q9GZZ0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXD1Q9GZZ0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXD1Q9GZZ0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXD1Q9GZZ0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXD1Q9GZZ0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXD1Q9GZZ0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXD1Q9GZZ0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXD1Q9GZZ0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXD1Q9GZZ0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXD1Q9GZZ0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXD1Q9GZZ0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXD1Q9GZZ0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXD1Q9GZZ0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXD1Q9GZZ0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXD1Q9GZZ0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXD1Q9GZZ0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXD1Q9GZZ0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXD1Q9GZZ0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXD1Q9GZZ0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXD1Q9GZZ0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXD1Q9GZZ0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXD1Q9GZZ0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXD1Q9GZZ0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXD1Q9GZZ0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXD1Q9GZZ0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXD1Q9GZZ0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXD1Q9GZZ0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXD1Q9GZZ0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXD1Q9GZZ0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXD1Q9GZZ0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXD1Q9GZZ0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXD1Q9GZZ0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXD1Q9GZZ0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXD1Q9GZZ0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXD1Q9GZZ0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXD1Q9GZZ0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXD1Q9GZZ0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXD1Q9GZZ0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
HOXD1Q9GZZ0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
HOXD1Q9GZZ0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXD1Q9GZZ0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXD1Q9GZZ0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXD1Q9GZZ0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXD1Q9GZZ0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXD1Q9GZZ0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXD1Q9GZZ0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXD1Q9GZZ0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXD1Q9GZZ0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXD1Q9GZZ0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXD1Q9GZZ0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXD1Q9GZZ0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXD1Q9GZZ0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXD1Q9GZZ0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXD1Q9GZZ0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXD1Q9GZZ0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXD1Q9GZZ0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXD1Q9GZZ0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD1Q9GZZ0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD1Q9GZZ0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD1Q9GZZ0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD1Q9GZZ0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD1Q9GZZ0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD1Q9GZZ0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD1Q9GZZ0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD1Q9GZZ0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD1Q9GZZ0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD1Q9GZZ0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD1Q9GZZ0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD1Q9GZZ0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD1Q9GZZ0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD1Q9GZZ0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD1Q9GZZ0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXD1Q9GZZ0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXD1Q9GZZ0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXD1Q9GZZ0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXD1Q9GZZ0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXD1Q9GZZ0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXD1Q9GZZ0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXD1Q9GZZ0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXD1Q9GZZ0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXD1Q9GZZ0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXD1Q9GZZ0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXD1Q9GZZ0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXD1Q9GZZ0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXD1Q9GZZ0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXD1Q9GZZ0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXD1Q9GZZ0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXD1Q9GZZ0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXD1Q9GZZ0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXD1Q9GZZ0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXD1Q9GZZ0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXD1Q9GZZ0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXD1Q9GZZ0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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