Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZR7

DDX24, ATP-dependent RNA helicase DDX24, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX24Q9GZR7 PFKM-203ENST00000359794 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.775e-6■■■■■ 34.6
DDX24Q9GZR7 PFKM-209ENST00000547581 3579 ntTSL 29.95□□□□□ -0.825e-6■■■■■ 34.6
DDX24Q9GZR7 ARMC8-210ENST00000469044 4790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.825e-6■■■■■ 34.6
DDX24Q9GZR7 GOLGA8B-202ENST00000438958 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.855e-6■■■■■ 34.6
DDX24Q9GZR7 SENP1-210ENST00000552189 4967 ntTSL 1 (best)9.65□□□□□ -0.865e-6■■■■■ 34.6
DDX24Q9GZR7 NAT10-203ENST00000529523 561 ntTSL 49.63□□□□□ -0.877e-7■■■■■ 34.6
DDX24Q9GZR7 RBM19-206ENST00000552386 692 ntTSL 29.62□□□□□ -0.875e-6■■■■■ 34.6
DDX24Q9GZR7 DIS3L2-216ENST00000498319 564 ntTSL 59.56□□□□□ -0.885e-6■■■■■ 34.6
DDX24Q9GZR7 AREL1-211ENST00000555330 4855 ntTSL 59.56□□□□□ -0.885e-6■■■■■ 34.6
DDX24Q9GZR7 CFLAR-201ENST00000309955 14672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.915e-6■■■■■ 34.6
DDX24Q9GZR7 ANKFY1-207ENST00000573250 588 ntTSL 59.07□□□□□ -0.965e-6■■■■■ 34.6
DDX24Q9GZR7 NABP1-209ENST00000462824 567 ntTSL 48.9□□□□□ -0.985e-6■■■■■ 34.6
DDX24Q9GZR7 PFKM-231ENST00000553055 289 ntTSL 58.71□□□□□ -1.025e-6■■■■■ 34.6
DDX24Q9GZR7 CFLAR-223ENST00000479953 1230 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.035e-6■■■■■ 34.6
DDX24Q9GZR7 SENP1-201ENST00000448372 4679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.035e-6■■■■■ 34.6
DDX24Q9GZR7 WAPL-203ENST00000372075 1799 ntTSL 28.58□□□□□ -1.045e-6■■■■■ 34.6
DDX24Q9GZR7 CFLAR-212ENST00000440180 1198 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.045e-6■■■■■ 34.6
DDX24Q9GZR7 ZCCHC8-205ENST00000540586 1250 ntTSL 28.51□□□□□ -1.055e-6■■■■■ 34.6
DDX24Q9GZR7 EXOC1-204ENST00000504321 582 ntTSL 38.36□□□□□ -1.075e-6■■■■■ 34.6
DDX24Q9GZR7 TTLL5-214ENST00000556173 3989 ntTSL 28.14□□□□□ -1.115e-6■■■■■ 34.6
DDX24Q9GZR7 CFLAR-207ENST00000417748 684 ntTSL 47.75□□□□□ -1.175e-6■■■■■ 34.6
DDX24Q9GZR7 CREB1-211ENST00000452474 518 ntTSL 47.65□□□□□ -1.185e-6■■■■■ 34.6
DDX24Q9GZR7 CREB1-216ENST00000494094 580 ntTSL 27.65□□□□□ -1.185e-6■■■■■ 34.6
DDX24Q9GZR7 ARMC8-205ENST00000463485 1059 ntTSL 37.28□□□□□ -1.245e-6■■■■■ 34.6
DDX24Q9GZR7 NABP1-204ENST00000410026 11521 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.255e-6■■■■■ 34.6
DDX24Q9GZR7 CFLAR-220ENST00000470178 516 ntTSL 27.1□□□□□ -1.275e-6■■■■■ 34.6
DDX24Q9GZR7 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.285e-6■■■■■ 34.6
DDX24Q9GZR7 ATM-208ENST00000525537 583 ntTSL 46.93□□□□□ -1.35e-6■■■■■ 34.6
DDX24Q9GZR7 SCP2-215ENST00000529363 720 ntTSL 56.82□□□□□ -1.325e-6■■■■■ 34.6
DDX24Q9GZR7 CLSTN3-215ENST00000544584 546 ntTSL 46.82□□□□□ -1.325e-6■■■■■ 34.6
DDX24Q9GZR7 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.335e-6■■■■■ 34.6
DDX24Q9GZR7 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.335e-6■■■■■ 34.6
DDX24Q9GZR7 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.345e-6■■■■■ 34.6
DDX24Q9GZR7 TTLL5-212ENST00000555290 592 ntTSL 46.59□□□□□ -1.355e-6■■■■■ 34.6
DDX24Q9GZR7 ATM-211ENST00000527389 401 ntTSL 46.38□□□□□ -1.395e-6■■■■■ 34.6
DDX24Q9GZR7 CFLAR-218ENST00000461820 830 ntTSL 26.19□□□□□ -1.425e-6■■■■■ 34.6
DDX24Q9GZR7 CFLAR-217ENST00000461422 717 ntTSL 26.19□□□□□ -1.425e-6■■■■■ 34.6
DDX24Q9GZR7 EXOC1-207ENST00000509302 586 ntTSL 46.03□□□□□ -1.445e-6■■■■■ 34.6
DDX24Q9GZR7 TSR1-203ENST00000575049 387 ntTSL 35.9□□□□□ -1.465e-6■■■■■ 34.6
DDX24Q9GZR7 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.495e-6■■■■■ 34.6
DDX24Q9GZR7 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.535e-6■■■■■ 34.6
DDX24Q9GZR7 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.535e-6■■■■■ 34.6
DDX24Q9GZR7 ARMC8-216ENST00000471709 691 ntTSL 35.44□□□□□ -1.545e-6■■■■■ 34.6
DDX24Q9GZR7 NABP1-206ENST00000435931 915 ntTSL 55.24□□□□□ -1.575e-6■■■■■ 34.6
DDX24Q9GZR7 FUBP3-202ENST00000465949 676 ntTSL 55.02□□□□□ -1.615e-6■■■■■ 34.6
DDX24Q9GZR7 EXOC1-208ENST00000511971 3203 ntTSL 24.96□□□□□ -1.625e-6■■■■■ 34.6
DDX24Q9GZR7 CFLAR-219ENST00000462763 588 ntTSL 24.85□□□□□ -1.635e-6■■■■■ 34.6
DDX24Q9GZR7 MTHFD1L-205ENST00000421497 373 ntTSL 34.74□□□□□ -1.655e-6■■■■■ 34.6
DDX24Q9GZR7 PPP2R5E-205ENST00000556150 744 ntTSL 34.73□□□□□ -1.655e-6■■■■■ 34.6
DDX24Q9GZR7 TBCK-210ENST00000506280 532 ntTSL 54.63□□□□□ -1.675e-6■■■■■ 34.6
DDX24Q9GZR7 VPS41-213ENST00000485955 571 ntTSL 44.55□□□□□ -1.688e-21■■■■■ 34.6
DDX24Q9GZR7 GTF2IRD1-206ENST00000486086 440 ntTSL 24.29□□□□□ -1.725e-6■■■■■ 34.6
DDX24Q9GZR7 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.735e-6■■■■■ 34.6
DDX24Q9GZR7 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.765e-6■■■■■ 34.6
DDX24Q9GZR7 TBCK-216ENST00000509862 600 ntTSL 43.45□□□□□ -1.865e-6■■■■■ 34.6
DDX24Q9GZR7 CREB1-207ENST00000445803 651 ntTSL 43.24□□□□□ -1.895e-6■■■■■ 34.6
DDX24Q9GZR7 ATM-205ENST00000525012 258 ntTSL 1 (best)3.19□□□□□ -1.95e-6■■■■■ 34.6
DDX24Q9GZR7 ATM-220ENST00000533526 234 ntTSL 1 (best)3.19□□□□□ -1.95e-6■■■■■ 34.6
DDX24Q9GZR7 ARMC8-214ENST00000470842 375 ntTSL 52.83□□□□□ -1.965e-6■■■■■ 34.6
DDX24Q9GZR7 CC2D1B-203ENST00000438021 2521 ntTSL 1 (best)15.06■□□□□ 04e-7■■■■■ 34.6
DDX24Q9GZR7 MROH1-205ENST00000527552 5832 ntTSL 1 (best)15.24■□□□□ 0.037e-7■■■■■ 34.6
DDX24Q9GZR7 MROH1-208ENST00000532255 3905 ntTSL 212.87□□□□□ -0.357e-7■■■■■ 34.6
DDX24Q9GZR7 SS18L1-201ENST00000331758 4493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.593e-6■■■■■ 34.5
DDX24Q9GZR7 VPS13B-206ENST00000496144 5625 ntTSL 510.25□□□□□ -0.774e-7■■■■■ 34.5
DDX24Q9GZR7 VPS13B-202ENST00000357162 14019 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.184e-7■■■■■ 34.5
DDX24Q9GZR7 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.34e-7■■■■■ 34.5
DDX24Q9GZR7 ATG16L2-218ENST00000542481 571 ntTSL 516.88■□□□□ 0.291e-6■■■■■ 34.5
DDX24Q9GZR7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.753e-7■■■■■ 34.5
DDX24Q9GZR7 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.783e-7■■■■■ 34.5
DDX24Q9GZR7 AP1G2-224ENST00000556741 353 ntTSL 214.2□□□□□ -0.141e-8■■■■■ 34.5
DDX24Q9GZR7 AP1G2-219ENST00000555789 318 ntTSL 311.27□□□□□ -0.611e-8■■■■■ 34.5
DDX24Q9GZR7 AP1G2-221ENST00000555974 349 ntTSL 39.84□□□□□ -0.831e-8■■■■■ 34.5
DDX24Q9GZR7 FANCA-224ENST00000567510 461 ntTSL 38.17□□□□□ -1.11e-7■■■■■ 34.4
DDX24Q9GZR7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.681e-6■■■■■ 34.4
DDX24Q9GZR7 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.41e-6■■■■■ 34.4
DDX24Q9GZR7 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.881e-6■■■■■ 34.4
DDX24Q9GZR7 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.751e-6■■■■■ 34.4
DDX24Q9GZR7 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.544e-6■■■■■ 34.4
DDX24Q9GZR7 KLHDC4-207ENST00000562155 1757 ntTSL 524.02■■□□□ 1.444e-6■■■■■ 34.4
DDX24Q9GZR7 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.394e-6■■■■■ 34.4
DDX24Q9GZR7 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.374e-6■■■■■ 34.4
DDX24Q9GZR7 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.194e-6■■■■■ 34.4
DDX24Q9GZR7 KLHDC4-202ENST00000316853 1287 ntTSL 1 (best)21.98■■□□□ 1.114e-6■■■■■ 34.4
DDX24Q9GZR7 KLHDC4-225ENST00000569487 2072 ntTSL 221.44■■□□□ 1.024e-6■■■■■ 34.4
DDX24Q9GZR7 KLHDC4-215ENST00000566349 1377 ntTSL 221.06■□□□□ 0.964e-6■■■■■ 34.4
DDX24Q9GZR7 KLHDC4-223ENST00000568499 445 ntTSL 318.09■□□□□ 0.494e-6■■■■■ 34.4
DDX24Q9GZR7 KLHDC4-218ENST00000567298 4572 ntTSL 517.02■□□□□ 0.314e-6■■■■■ 34.4
DDX24Q9GZR7 TMEM43-201ENST00000306077 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.794e-6■■■■■ 34.4
DDX24Q9GZR7 ORC3-206ENST00000546266 2470 ntTSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.084e-6■■■■■ 34.4
DDX24Q9GZR7 ORC3-202ENST00000392844 2512 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.474e-6■■■■■ 34.4
DDX24Q9GZR7 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.614e-6■■■■■ 34.4
DDX24Q9GZR7 MGRN1-207ENST00000587145 577 ntTSL 413.75□□□□□ -0.211e-6■■■■■ 34.4
DDX24Q9GZR7 MGRN1-212ENST00000590457 552 ntTSL 313.75□□□□□ -0.211e-6■■■■■ 34.4
DDX24Q9GZR7 SKIV2L-202ENST00000461073 1157 ntTSL 218.33■□□□□ 0.522e-7■■■■■ 34.4
DDX24Q9GZR7 ARAP1-213ENST00000536993 315 ntTSL 213.07□□□□□ -0.321e-10■■■■■ 34.3
DDX24Q9GZR7 ZSWIM8-212ENST00000492395 4490 ntTSL 1 (best)14.6□□□□□ -0.075e-7■■■■■ 34.3
DDX24Q9GZR7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.836e-8■■■■■ 34.3
DDX24Q9GZR7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.276e-8■■■■■ 34.3
DDX24Q9GZR7 MCM3AP-208ENST00000494755 669 ntTSL 322.64■■□□□ 1.211e-8■■■■■ 34.2
DDX24Q9GZR7 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.541e-6■■■■■ 34.2
Retrieved 100 of 28,409 protein–RNA pairs in 171.8 ms