RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542481.1

ATG16L2-218, Transcript of autophagy related 16 like 2, humanhuman

TSL 5

Gene ATG16L2, Length 571 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2-218ENST00000542481 NISCHQ9Y2I1 1504 aa34.48■■■■□ 3.11
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ATG16L2-218ENST00000542481 MYO15BQ96JP2 1530 aa28.69■■■□□ 2.18
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ATG16L2-218ENST00000542481 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.45■■□□□ 1.99
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ATG16L2-218ENST00000542481 SMARCA2P51531 1590 aa26.65■■□□□ 1.86
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ATG16L2-218ENST00000542481 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.63■■□□□ 1.69
ATG16L2-218ENST00000542481 WDR62O43379 1518 aa25.59■■□□□ 1.69
ATG16L2-218ENST00000542481 PRDM2Q13029 1718 aa25.54■■□□□ 1.68
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ATG16L2-218ENST00000542481 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.68■■□□□ 1.54
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ATG16L2-218ENST00000542481 PBRM1Q86U86 1689 aa24.58■■□□□ 1.53
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ATG16L2-218ENST00000542481 TRIM41Q8WV44 630 aa24.51■■□□□ 1.51
ATG16L2-218ENST00000542481 ARHGEF11O15085 1522 aa24.47■■□□□ 1.51
ATG16L2-218ENST00000542481 SYNJ2O15056 1496 aa24.47■■□□□ 1.51
ATG16L2-218ENST00000542481 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
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ATG16L2-218ENST00000542481 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.32■■□□□ 1.48
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ATG16L2-218ENST00000542481 ARAP1Q96P48 1450 aa24.27■■□□□ 1.48
ATG16L2-218ENST00000542481 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.27■■□□□ 1.48
ATG16L2-218ENST00000542481 CEP170Q5SW79 1584 aa24.23■■□□□ 1.47
ATG16L2-218ENST00000542481 CYB5RLQ6IPT4 315 aa24.21■■□□□ 1.47
ATG16L2-218ENST00000542481 NUP160Q12769 1436 aa24.2■■□□□ 1.46
ATG16L2-218ENST00000542481 KIF27Q86VH2 1401 aa24.15■■□□□ 1.46
ATG16L2-218ENST00000542481 IGF1RP08069 1367 aa24.11■■□□□ 1.45
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ATG16L2-218ENST00000542481 SHROOM2Q13796 1616 aa24.07■■□□□ 1.44
ATG16L2-218ENST00000542481 CUL7Q14999 1698 aa24.06■■□□□ 1.44
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ATG16L2-218ENST00000542481 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa23.94■■□□□ 1.42
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