Protein–RNA interactions for Protein: Q96SB8

SMC6, Structural maintenance of chromosomes protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC6Q96SB8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMC6Q96SB8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMC6Q96SB8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMC6Q96SB8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMC6Q96SB8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMC6Q96SB8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SMC6Q96SB8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMC6Q96SB8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMC6Q96SB8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMC6Q96SB8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMC6Q96SB8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMC6Q96SB8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMC6Q96SB8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMC6Q96SB8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMC6Q96SB8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMC6Q96SB8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMC6Q96SB8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SMC6Q96SB8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMC6Q96SB8 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMC6Q96SB8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMC6Q96SB8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMC6Q96SB8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMC6Q96SB8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMC6Q96SB8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMC6Q96SB8 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMC6Q96SB8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMC6Q96SB8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMC6Q96SB8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMC6Q96SB8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMC6Q96SB8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMC6Q96SB8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMC6Q96SB8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
SMC6Q96SB8 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMC6Q96SB8 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMC6Q96SB8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMC6Q96SB8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMC6Q96SB8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMC6Q96SB8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMC6Q96SB8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMC6Q96SB8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMC6Q96SB8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMC6Q96SB8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMC6Q96SB8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMC6Q96SB8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMC6Q96SB8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SMC6Q96SB8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMC6Q96SB8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMC6Q96SB8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMC6Q96SB8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMC6Q96SB8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMC6Q96SB8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMC6Q96SB8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMC6Q96SB8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMC6Q96SB8 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMC6Q96SB8 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMC6Q96SB8 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMC6Q96SB8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMC6Q96SB8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMC6Q96SB8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMC6Q96SB8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMC6Q96SB8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMC6Q96SB8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMC6Q96SB8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMC6Q96SB8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMC6Q96SB8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMC6Q96SB8 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMC6Q96SB8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMC6Q96SB8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SMC6Q96SB8 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMC6Q96SB8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMC6Q96SB8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMC6Q96SB8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMC6Q96SB8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMC6Q96SB8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMC6Q96SB8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMC6Q96SB8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMC6Q96SB8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMC6Q96SB8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMC6Q96SB8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMC6Q96SB8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SMC6Q96SB8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMC6Q96SB8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMC6Q96SB8 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMC6Q96SB8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMC6Q96SB8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMC6Q96SB8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMC6Q96SB8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMC6Q96SB8 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SMC6Q96SB8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMC6Q96SB8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMC6Q96SB8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMC6Q96SB8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMC6Q96SB8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMC6Q96SB8 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMC6Q96SB8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMC6Q96SB8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMC6Q96SB8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMC6Q96SB8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMC6Q96SB8 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMC6Q96SB8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms