Protein–RNA interactions for Protein: Q96SB4

SRPK1, SRSF protein kinase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPK1Q96SB4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRPK1Q96SB4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SRPK1Q96SB4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRPK1Q96SB4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRPK1Q96SB4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRPK1Q96SB4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRPK1Q96SB4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRPK1Q96SB4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRPK1Q96SB4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRPK1Q96SB4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRPK1Q96SB4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SRPK1Q96SB4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRPK1Q96SB4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRPK1Q96SB4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SRPK1Q96SB4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRPK1Q96SB4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRPK1Q96SB4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRPK1Q96SB4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRPK1Q96SB4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRPK1Q96SB4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRPK1Q96SB4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRPK1Q96SB4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRPK1Q96SB4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRPK1Q96SB4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRPK1Q96SB4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRPK1Q96SB4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SRPK1Q96SB4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRPK1Q96SB4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRPK1Q96SB4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRPK1Q96SB4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRPK1Q96SB4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRPK1Q96SB4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRPK1Q96SB4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRPK1Q96SB4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRPK1Q96SB4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRPK1Q96SB4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRPK1Q96SB4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRPK1Q96SB4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRPK1Q96SB4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRPK1Q96SB4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRPK1Q96SB4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRPK1Q96SB4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SRPK1Q96SB4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRPK1Q96SB4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRPK1Q96SB4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SRPK1Q96SB4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRPK1Q96SB4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRPK1Q96SB4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRPK1Q96SB4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRPK1Q96SB4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRPK1Q96SB4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRPK1Q96SB4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRPK1Q96SB4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRPK1Q96SB4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRPK1Q96SB4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRPK1Q96SB4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRPK1Q96SB4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRPK1Q96SB4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRPK1Q96SB4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRPK1Q96SB4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRPK1Q96SB4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRPK1Q96SB4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRPK1Q96SB4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRPK1Q96SB4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRPK1Q96SB4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRPK1Q96SB4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRPK1Q96SB4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRPK1Q96SB4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRPK1Q96SB4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRPK1Q96SB4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRPK1Q96SB4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRPK1Q96SB4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SRPK1Q96SB4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRPK1Q96SB4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRPK1Q96SB4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRPK1Q96SB4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRPK1Q96SB4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRPK1Q96SB4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRPK1Q96SB4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRPK1Q96SB4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRPK1Q96SB4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRPK1Q96SB4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRPK1Q96SB4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRPK1Q96SB4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRPK1Q96SB4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRPK1Q96SB4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRPK1Q96SB4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRPK1Q96SB4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRPK1Q96SB4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRPK1Q96SB4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRPK1Q96SB4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRPK1Q96SB4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRPK1Q96SB4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRPK1Q96SB4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRPK1Q96SB4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SRPK1Q96SB4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRPK1Q96SB4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRPK1Q96SB4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRPK1Q96SB4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRPK1Q96SB4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.2 ms