Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDQ0

HAVCR2, Hepatitis A virus cellular receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAVCR2Q8TDQ0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HAVCR2Q8TDQ0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HAVCR2Q8TDQ0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HAVCR2Q8TDQ0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HAVCR2Q8TDQ0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HAVCR2Q8TDQ0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HAVCR2Q8TDQ0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HAVCR2Q8TDQ0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HAVCR2Q8TDQ0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HAVCR2Q8TDQ0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HAVCR2Q8TDQ0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HAVCR2Q8TDQ0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HAVCR2Q8TDQ0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HAVCR2Q8TDQ0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HAVCR2Q8TDQ0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HAVCR2Q8TDQ0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HAVCR2Q8TDQ0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HAVCR2Q8TDQ0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HAVCR2Q8TDQ0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
HAVCR2Q8TDQ0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HAVCR2Q8TDQ0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HAVCR2Q8TDQ0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HAVCR2Q8TDQ0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HAVCR2Q8TDQ0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HAVCR2Q8TDQ0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HAVCR2Q8TDQ0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HAVCR2Q8TDQ0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HAVCR2Q8TDQ0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HAVCR2Q8TDQ0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HAVCR2Q8TDQ0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HAVCR2Q8TDQ0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HAVCR2Q8TDQ0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HAVCR2Q8TDQ0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HAVCR2Q8TDQ0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HAVCR2Q8TDQ0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HAVCR2Q8TDQ0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HAVCR2Q8TDQ0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HAVCR2Q8TDQ0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HAVCR2Q8TDQ0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HAVCR2Q8TDQ0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
HAVCR2Q8TDQ0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HAVCR2Q8TDQ0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HAVCR2Q8TDQ0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HAVCR2Q8TDQ0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HAVCR2Q8TDQ0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HAVCR2Q8TDQ0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HAVCR2Q8TDQ0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HAVCR2Q8TDQ0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
HAVCR2Q8TDQ0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HAVCR2Q8TDQ0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HAVCR2Q8TDQ0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HAVCR2Q8TDQ0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HAVCR2Q8TDQ0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HAVCR2Q8TDQ0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HAVCR2Q8TDQ0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HAVCR2Q8TDQ0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HAVCR2Q8TDQ0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HAVCR2Q8TDQ0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HAVCR2Q8TDQ0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HAVCR2Q8TDQ0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HAVCR2Q8TDQ0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HAVCR2Q8TDQ0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HAVCR2Q8TDQ0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
HAVCR2Q8TDQ0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HAVCR2Q8TDQ0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HAVCR2Q8TDQ0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HAVCR2Q8TDQ0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HAVCR2Q8TDQ0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HAVCR2Q8TDQ0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HAVCR2Q8TDQ0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HAVCR2Q8TDQ0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HAVCR2Q8TDQ0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HAVCR2Q8TDQ0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HAVCR2Q8TDQ0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HAVCR2Q8TDQ0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HAVCR2Q8TDQ0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HAVCR2Q8TDQ0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HAVCR2Q8TDQ0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HAVCR2Q8TDQ0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HAVCR2Q8TDQ0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HAVCR2Q8TDQ0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HAVCR2Q8TDQ0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HAVCR2Q8TDQ0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HAVCR2Q8TDQ0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HAVCR2Q8TDQ0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HAVCR2Q8TDQ0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HAVCR2Q8TDQ0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HAVCR2Q8TDQ0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HAVCR2Q8TDQ0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HAVCR2Q8TDQ0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
HAVCR2Q8TDQ0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HAVCR2Q8TDQ0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HAVCR2Q8TDQ0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HAVCR2Q8TDQ0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HAVCR2Q8TDQ0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HAVCR2Q8TDQ0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HAVCR2Q8TDQ0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HAVCR2Q8TDQ0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HAVCR2Q8TDQ0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HAVCR2Q8TDQ0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms