Protein–RNA interactions for Protein: Q8N567

ZCCHC9, Zinc finger CCHC domain-containing protein 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC9Q8N567 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZCCHC9Q8N567 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZCCHC9Q8N567 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZCCHC9Q8N567 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZCCHC9Q8N567 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZCCHC9Q8N567 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZCCHC9Q8N567 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZCCHC9Q8N567 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZCCHC9Q8N567 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZCCHC9Q8N567 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZCCHC9Q8N567 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZCCHC9Q8N567 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZCCHC9Q8N567 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZCCHC9Q8N567 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZCCHC9Q8N567 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZCCHC9Q8N567 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZCCHC9Q8N567 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZCCHC9Q8N567 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZCCHC9Q8N567 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZCCHC9Q8N567 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZCCHC9Q8N567 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZCCHC9Q8N567 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ZCCHC9Q8N567 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZCCHC9Q8N567 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZCCHC9Q8N567 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZCCHC9Q8N567 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZCCHC9Q8N567 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZCCHC9Q8N567 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZCCHC9Q8N567 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZCCHC9Q8N567 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZCCHC9Q8N567 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZCCHC9Q8N567 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZCCHC9Q8N567 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZCCHC9Q8N567 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZCCHC9Q8N567 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZCCHC9Q8N567 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZCCHC9Q8N567 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZCCHC9Q8N567 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZCCHC9Q8N567 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZCCHC9Q8N567 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZCCHC9Q8N567 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZCCHC9Q8N567 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZCCHC9Q8N567 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZCCHC9Q8N567 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZCCHC9Q8N567 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZCCHC9Q8N567 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZCCHC9Q8N567 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZCCHC9Q8N567 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZCCHC9Q8N567 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZCCHC9Q8N567 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZCCHC9Q8N567 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZCCHC9Q8N567 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZCCHC9Q8N567 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZCCHC9Q8N567 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZCCHC9Q8N567 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZCCHC9Q8N567 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZCCHC9Q8N567 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZCCHC9Q8N567 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ZCCHC9Q8N567 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZCCHC9Q8N567 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZCCHC9Q8N567 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZCCHC9Q8N567 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZCCHC9Q8N567 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZCCHC9Q8N567 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZCCHC9Q8N567 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZCCHC9Q8N567 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZCCHC9Q8N567 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZCCHC9Q8N567 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ZCCHC9Q8N567 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZCCHC9Q8N567 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZCCHC9Q8N567 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZCCHC9Q8N567 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZCCHC9Q8N567 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZCCHC9Q8N567 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZCCHC9Q8N567 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZCCHC9Q8N567 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZCCHC9Q8N567 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZCCHC9Q8N567 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZCCHC9Q8N567 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ZCCHC9Q8N567 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZCCHC9Q8N567 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ZCCHC9Q8N567 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ZCCHC9Q8N567 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZCCHC9Q8N567 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZCCHC9Q8N567 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ZCCHC9Q8N567 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ZCCHC9Q8N567 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZCCHC9Q8N567 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZCCHC9Q8N567 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZCCHC9Q8N567 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ZCCHC9Q8N567 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZCCHC9Q8N567 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZCCHC9Q8N567 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZCCHC9Q8N567 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZCCHC9Q8N567 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZCCHC9Q8N567 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZCCHC9Q8N567 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZCCHC9Q8N567 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZCCHC9Q8N567 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ZCCHC9Q8N567 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms