Protein–RNA interactions for Protein: Q86V81

ALYREF, THO complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREFQ86V81 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALYREFQ86V81 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALYREFQ86V81 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALYREFQ86V81 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ALYREFQ86V81 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALYREFQ86V81 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALYREFQ86V81 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALYREFQ86V81 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALYREFQ86V81 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALYREFQ86V81 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALYREFQ86V81 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALYREFQ86V81 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ALYREFQ86V81 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALYREFQ86V81 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALYREFQ86V81 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALYREFQ86V81 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALYREFQ86V81 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALYREFQ86V81 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALYREFQ86V81 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALYREFQ86V81 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALYREFQ86V81 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALYREFQ86V81 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ALYREFQ86V81 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ALYREFQ86V81 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ALYREFQ86V81 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ALYREFQ86V81 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ALYREFQ86V81 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ALYREFQ86V81 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ALYREFQ86V81 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ALYREFQ86V81 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ALYREFQ86V81 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALYREFQ86V81 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALYREFQ86V81 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALYREFQ86V81 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALYREFQ86V81 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALYREFQ86V81 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALYREFQ86V81 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALYREFQ86V81 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALYREFQ86V81 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALYREFQ86V81 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALYREFQ86V81 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALYREFQ86V81 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ALYREFQ86V81 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALYREFQ86V81 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALYREFQ86V81 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALYREFQ86V81 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALYREFQ86V81 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALYREFQ86V81 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ALYREFQ86V81 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ALYREFQ86V81 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ALYREFQ86V81 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ALYREFQ86V81 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ALYREFQ86V81 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALYREFQ86V81 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALYREFQ86V81 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALYREFQ86V81 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALYREFQ86V81 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALYREFQ86V81 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALYREFQ86V81 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALYREFQ86V81 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALYREFQ86V81 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALYREFQ86V81 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ALYREFQ86V81 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ALYREFQ86V81 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ALYREFQ86V81 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ALYREFQ86V81 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ALYREFQ86V81 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ALYREFQ86V81 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALYREFQ86V81 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALYREFQ86V81 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALYREFQ86V81 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALYREFQ86V81 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ALYREFQ86V81 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALYREFQ86V81 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALYREFQ86V81 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALYREFQ86V81 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALYREFQ86V81 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALYREFQ86V81 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALYREFQ86V81 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ALYREFQ86V81 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ALYREFQ86V81 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ALYREFQ86V81 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ALYREFQ86V81 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ALYREFQ86V81 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ALYREFQ86V81 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ALYREFQ86V81 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ALYREFQ86V81 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ALYREFQ86V81 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ALYREFQ86V81 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ALYREFQ86V81 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ALYREFQ86V81 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ALYREFQ86V81 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ALYREFQ86V81 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ALYREFQ86V81 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ALYREFQ86V81 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ALYREFQ86V81 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ALYREFQ86V81 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ALYREFQ86V81 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ALYREFQ86V81 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ALYREFQ86V81 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms